非人类法医学研究→
目前DNA 测序也已被用于表征谱系或物种多样性研究来进行人类和非人类鉴定。同时,第二代和第三代测序方法的出现正逐步使法医遗传分析转移到高通量测序 (HTS) 平台上,以便用于个体化和更高级别的分类。野生动物法医学是法医遗传学的一个组成部分,其特点是证明样本中存在的动植物分类群以及结合专业进化和种群遗传知识来解释分析结果,这对于生物多样性丰富的国家显得尤为重要。本文将带大家了解非人类法医学的相关知识以及基于DNA序列进行物种鉴定的相关内容。
目前DNA 测序也已被用于表征谱系或物种多样性研究来进行人类和非人类鉴定。同时,第二代和第三代测序方法的出现正逐步使法医遗传分析转移到高通量测序 (HTS) 平台上,以便用于个体化和更高级别的分类。野生动物法医学是法医遗传学的一个组成部分,其特点是证明样本中存在的动植物分类群以及结合专业进化和种群遗传知识来解释分析结果,这对于生物多样性丰富的国家显得尤为重要。本文将带大家了解非人类法医学的相关知识以及基于DNA序列进行物种鉴定的相关内容。
尽管二代测序已经在当前多个法医领域展露头脚,其在多重位点检测、低浓度样本分析和降解样本研究中展现了强大的潜力,但其固有的短读长限制可能导致对复杂基因组结构、重复区域和大片段变异的解析存在一定局限。正因如此,而Oxford Nanopore Technologies(ONT)和PacBio为代表的第三代测序技术(TGS)的出现和发展,为法医遗传学和物证学研究带来了新的可能。
新一代测序(NGS)或大规模平行测序(MPS)是一种突破性的高通量技术,能够在短时间内对DNA和RNA分子进行大规模、高精度的分析。与传统的Sanger测序相比,NGS技术具备显著的优势,包括更高的灵敏度、更强的可扩展性和更快的分析速度。NGS不仅能为科学研究提供更为丰富的数据支持,还逐步在法医学领域获得广泛应用。
在生物信息学中常见的有关测序数据或是临床信息,需要用到的一些统计分布,仅仅涉及到通俗易懂的基础感性概念,方便大家理解👀
在下载原始的单细胞测序数据时,我们都苦恼一个样本几十个G怎么可以高速下载,抛弃原始的wget下载方式,让你的数据下载上高速🛣️👇🫡
传统的单细胞测序分析用到的主要分析工具为R的Seurat包,但是对于R语言使用不太熟练的生信工作者,或者是以python为主要编程语言的人,对于Seurat的使用和理解总是不太熟悉。所以本篇文章主要基于python的Scanpy包对单细胞测序数据进行分析,希望可以对你的数据处理有所帮助🎉🎈🍾👇
单细胞测序从参考基因组构建开始👇